Die Muscadelle bevorzugt gut durchlässige Böden, oft auf Lehm-Kalkstein-Basis, die ihr eine gute Mineralität verleihen. Ihre dünne Beerenhaut macht sie anfällig für verschiedene Fäulnisarten, weshalb ein sorgfältiges Management des Blätterdachs und eine gute Luftzirkulation entscheidend sind. In kühleren Regionen oder bei ungeeigneter Witterung kann dies eine Herausforderung für den nachhaltigen Anbau darstellen. Sie profitiert von Morgenfrösten und nebligen Bedingungen, die die Entwicklung der Edelfäule fördern, muss aber gleichzeitig vor Graufäule geschützt werden. Der Trend geht zu integriertem oder biologischem Anbau, um die empfindliche Rebe im Gleichgewicht mit ihrer Umwelt zu halten.